Publicação

Saudações portuenses!

As temperaturas resolveram subir novamente, essa semana começou com dias quentes, prenúncio do verão que aproxima-se. Hoje reavaliamos algumas etapas do trabalho e acabamos por definir outras. Afinal de contas temos prazos que precisam ser cumpridos para submetermos um paper a uma nova conferência.

Por falar em conferências, já está disponível o livro "Distributed Computing, Artificial Intelligence, Bioinformatics, Soft Computing and Ambient Assisted Living" publicado pela Springer (versão online). Uma coletânea de artigos científicos, dentre eles, o nosso artigo "Visually Guiding and Controlling the Search While Mining Chemical Structures" (disponível online).

Bem, por aqui a vida segue e apesar da crise, que agora já não é notícia de primeira página, não podemos nos queixar. Afinal de contas a inflação baixou pelo terceiro mês. Desde o início do ano os combustíveis já baixaram 14,7%, as frutas 9,2%, óleo e afins 8,2%, gás 7,7%, leite 5,2%, produtos farmacêuticos 4,2%, etc... Afinal não está tão ruim assim :-)

Grande abraço.

Boas notícias

Saudações portistas!

É isso mesmo, o Futebol Clube do Porto é campeão! Ainda faltam duas rodadas para terminar o campeonato e mesmo assim o Porto já assegurou o título. Diga-se de passagem, pela quarta vez consecutiva (tetra-campeão). E nós, como bons adeptos (torcedores) do Porto, ficamos orgulhosos :-)

Bem, por aqui os trabalhos estão a todo o vapor e mais uma vez tivemos o aceite para publicação de um outro artigo. Desta vez no Congresso da Sociedade Brasileira de Computação (CSBC 2009) no Workshop de Informática Médica (WIM 2009). Não posso reclamar, as coisas estão correndo muito bem.

Ah, ontem terminei de ler o livro "A Cura de Schopenhauer" do mesmo autor de "Quando Nietzsche Chorou". Confesso que esperava mais do livro, talvez influenciado pela expectativa gerada depois de ter lido o primeiro. Preciso admitir que não sou "fã" de psicanálise. Talvez esteja até errado, pois nunca participei de um grupo ou realizei qualquer terapia individual. É uma opinião sem fundamentos dirão os especialistas. E, nesse caso, alguns podem até dizer que "na falta de argumentos" melhor se calar. Bem, de qualquer forma, digo isso pois o livro utiliza a terapia de grupo e detem-se demasiado, na minha opinião, a investigar o inconsciente das personagens utilizando tal recurso. Para não polemizar e não cruzar a fronteira entre a simples opinião e o disparate, fico por aqui. Mas o que mais gostei foi de conhecer um pouco mais sobre a filosofia de Schopenhauer (o filósofo pessimista).

As fotos são da Reitoria da Universidade do Porto e uma vista da Faculdade de Engenharia (FEUP).

Um grande abraço.

Mais trabalhos

Saudações portuenses!

Hoje recebi mais uma excelente notícia em relação aos trabalhos desenvolvidos por aqui. Tivemos mais um parecer favorável para outra publicação, desta vez, no Brazilian Symposium on Bioinformatics - http://www.inf.pucrs.br/~bsb2009/
Um evento de referência na área de bioinformática que desde 2005 tem por objetivo divulgar e discutir trabalhos de pesquisa na área. Além da apresentação do trabalho no simpósio, o artigo será publicado pela Springer como Lecture Notes on Bioinformatics (http://www.springer.com/series/5381). Uma subsérie da LNCS com trabalhos na área de bioinformática e biologia computacional.

Bem, os trabalhos continuam. Novos experimentos estão sendo feitos e os deadlines estão aí.

Abraços.

Trabalhos

Saudações portistas!

Pois é, o FC Porto está nas quartas-de-final da Champions League, foi um grande jogo apesar do empate sem gols. Agora, na luta pelo título, estão Manchester United, Chelsea, Arsenal, Liverpool, Barcelona, Bayern, Villarreal e, claro, o Porto. Vamos a isso!

Bem, agora sobrou um tempinho para escrever algo. Durante as últimas semanas não tive muito tempo em função dos trabalhos e dos prazos. Mas felizmente há grandes progressos e isso é o que importa, o trabalho começa a dar frutos. Na semana passada tivemos a confirmação de aceite de um paper que submetemos a uma conferência na Espanha (Salamanca) - Third International Workshop on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics (IWPACBB'09) - http://iwpacbb.usal.es. Os trabalhos continuam a todo vapor, pois ainda temos planos para outras conferências e os deadlines estão aí. Por isso, mãos à obra!

Um grande abraço.

Trabalho

Saudações!

O tempo tem passado muito rápido por aqui. Temos a impressão de que os dias são mais curtos do que no Brasil...tolice é claro, mas o fuso horário tem contribuído para essa falsa impressão. Afinal de contas são 4 horas de diferença! Então quando todos estão acordando aí no Brasil já estamos quase almoçando aqui em Portugal. Apesar de que a partir do final de outubro o horário de verão português acaba e logo começa o horário de verão brasileiro, sendo assim, a diferença vai cair para apenas 2 horas.

É, mas o trabalho também tem feito o tempo passar depressa. Depois de alguns meses a rotina de estudos ficou mais específica e mais intensa também. Os objetivos estão bem mais claros, pois as reuniões, conversas com outros pesquisadores e os estudos mais aprofundados acabam por esclarecer pontos que ainda permaneciam obscuros. O ambiente de trabalho por aqui não podia estar melhor, bons recursos e ótima estrutura. O dia-a-dia no laboratório tem sido muito prazeroso, as reuniões com os pesquisadores muito elucidativas e o esforço tem valido a pena. Tenho trabalhado com algumas ferramentas e linguagens bastante interessantes, sem contar a abordagem computacional que eu apenas conhecia superficialmente.

Já há algum tempo tenho estudado e trabalhado com o intuito de formar um base sólida na área de bioinformática, isso remonta aos meus estudos durante o doutorado, no entanto aqui, tenho percebido que realmente essa área tem se tornado, se não imprescindível, extremamente importante. E fica evidente que não há como se aventurar nessa área sem básicos conhecimentos de outras áreas, principalmente biologia molecular e química. Há muita pesquisa sendo feita nessa área, como já há também muitos trabalhos disponíveis. Acredito que todas as universidades brasileiras deveriam ter um ou mais grupos de pesquisa trabalhando nessa área. Essa iniciativa não deve ser encarada apenas como uma extensão da pesquisa que já vem sendo feita em outros grupos, mas ela deve ter um caráter estratégico, pois não consigo enxergar um futuro sem a união das ciências da vida com a informática.

Um forte abraço e até a próxima.

LIAAD

Olá pessoal.

Bem, hoje o dia amanheceu chuvoso aqui no Porto. A temperatura caiu bastante em relação aos últimos dez dias. O dia está ótimo para o trabalho. Por falar em trabalho, vou falar um pouco sobre o Laboratório de Inteligência Artificial e Análise de Dados - LIAAD.

O LIAAD foi fundando em 1988 com o nome de LIACC (Laboratório de Inteligência Artificial e Ciência da Computação). O laboratório conta hoje com 28 pesquisadores efetivos, sendo 15 doutores e os demais alunos de doutorado, além de vários outros pesquisadores colaboradores, de outras universidades. O Laboratório é coordenado pelo Dr. Pavel Brazdil, professor catedrático da Universidade do Porto.
O foco da pesquisa, aqui no laboratório, é Machine Learning. Mas, algunas áreas de pesquisa acabam se destacando: Data Mining and Decision Support, Modeling Dynamic Systems, Advanced Techniques in Data Mining and Data Analysis, Data Mining for Text and Web.

O ambiente de trabalho no laboratório é excelente. Sem falar na estrutura (computadores, livros, equipamentos diversos e demais recursos). O laboratório, através dos seus pesquisadores, participa ativamente de várias conferências e congressos nacionais e internacionais. Há um número bastante expressivo de publicações, o que acaba elevando o conceito do laboratório junto a universidade e conseqüentemente junto a Fundação para Ciência e Tecnologia de Portugal.

Tenho passado boa parte do meu tempo no laboratório e, às vezes, em casa no que eu chamo de “mesa de trabalho”. Nos últimos dias tenho trabalhado no desenvolvimento de um módulo do software LogCHEM (desenvolvido pelos pesquisadores da universidade). O objetivo é desenvolver um módulo interativo para manipulação de moléculas em 3D utilizando o VMD (Visual Molecular Dynamics). Estou trabalhando com a linguagem Tcl/Tk para interagir com o VMD. Depois das alterações na molécula é preciso, ainda, enviar as informações dessa molécula (descritores moleculares) para um sistema de ILP (Inductive Logic Programming) para mineração dos fragmentos químicos. Para que o sistema de ILP possa funcionar corretamente, além de um bom dataset, é preciso construir regras e fatos utilizando a linguagem Prolog, por isso, tenho estudado bastante essa linguagem também.

O que torna esse trabalho extremamente prazeroso é a quantidade de técnicas e conhecimentos envolvidos.

That’s all folks!

Abraços.